Mramorni oltar sv. Ignancija izradio je (1728. - 1729.) slovenski barokni kipar Francesco Robba, koji je prema nekim podacima i pokopan u kripti crkve. S obzirom na kompoziciju i izvedbu ovaj oltar je zasigurno najvrjednije djelo u ovoj crkvi i predstavlja vrhunac barokne skulpture u Zagrebu, a čak i u ovom dijelu Europe. Ovaj oltar simetrično krase dva barokna piramidalna relikvijara izvedena u srebru. Iza glavnog oltara nalazi se velika fresko slika koja prikazuje Svetu Katarina među aleksandrijskim filozofima i književnicima. Sliku je izradio Andrija Ilovšek (sin Franje Ilovšeka) iz Ljubljane. Izradu ove slike darovala je obitelj Erdody. Posebni ugođaj unutar ove prelijepe crkve svakako podižu i njezini vitraji, koji su nažalost samo sa sjeverne strane lađe. Za gradnju crkve, a poglavito za njezino unutarnje uređenje, novac je darovalo hrvatsko plemstvo. visokog, među kojima se ističu članovi obitelji Erdody, Bedeković i dr. Neki od darovatelja su pokopani u samoj crkvi.